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Rapports scientifiques volume 13, Numéro d'article : 10342 (2023) Citer cet article

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Le virus de la peste porcine africaine (ASFV) est un pathogène animal mortel qui pénètre dans ses cellules hôtes par endocytose. Jusqu’à présent, les facteurs de l’hôte spécifiquement requis pour la réplication du virus ASFV ont été à peine identifiés. Dans cette étude, un criblage knock-out CRISPR/Cas9 à l'échelle du génome dans des cellules porcines a indiqué que les gènes RFXANK, RFXAP, SLA-DMA, SLA-DMB et CIITA sont importants pour une infection productive par le virus de la peste porcine africaine. Les protéines codées par ces gènes appartiennent au complexe majeur d'histocompatibilité II (MHC II) ou au complexe antigénique leucocytaire porcin II (SLA II). RFXAP et CIITA sont des facteurs de transcription spécifiques du CMH II, tandis que SLA-DMA/B sont des sous-unités de la molécule non classique du CMH II, SLA-DM. L'inactivation ciblée de l'un ou l'autre de ces gènes a conduit à de graves défauts de réplication de différents isolats du virus ASFV, reflétés par une efficacité de placage considérablement réduite, une propagation de cellule à cellule, des titres de virus de la descendance et une réplication de l'ADN viral. La reconstitution basée sur le transgène de SLA-DMA/B a entièrement restauré la capacité de réplication, démontrant que SLA-DM, qui réside dans les endosomes tardifs, joue un rôle crucial au cours des premières étapes de l'infection par le virus de la peste porcine africaine.

Le virus de la peste porcine africaine (PPA) est l'agent causal de la peste porcine africaine (PPA), une maladie hémorragique des porcs domestiques et des sangliers (espèce Sus scrofa)1,2,3. Le virus de la PPA a été identifié pour la première fois au Kenya en 1921 et a depuis été signalé dans la plupart des pays d'Afrique subsaharienne4,5. Par séquençage partiel du gène B646L, qui code pour la protéine majeure de la capside p72, vingt-quatre génotypes de PPA ont été spécifiés6,7. Jusqu’à présent, seuls deux d’entre eux, le génotype I et le génotype II, ont été détectés en dehors de l’Afrique, le génotype II étant responsable de la panzootie actuelle. Depuis l’introduction du virus de la PPA en Géorgie en 2007, des foyers de PPA ont été signalés dans des pays de la région européenne, en Fédération de Russie, en Asie, en Océanie et dans les Amériques3,8,9 (site Internet OIE-Wahis, consulté en novembre 2022). Dans la plupart des pays touchés, le contrôle de la PPA se limite encore à des mesures de gestion des risques biologiques, à des approches de surveillance et à des stratégies de réponse, qui incluent l'abattage et des restrictions commerciales, et entraînent d'importantes pertes économiques et de production, car les vaccins homologués ne sont actuellement pas disponibles dans le commerce3.

ASFV is the only member of the genus Asfivirus of the family Asfarviridae10,11,12, (2020)." href="/articles/s41598-023-36788-9#ref-CR13" id="ref-link-section-d8432881e574"> 13. Son génome d'ADN double brin linéaire varie entre 170 et 193 kpb et contient 150 à 167 cadres de lecture ouverts codant pour des protéines14,15,16. L'existence de 134 protéines virales a été confirmée, mais pour beaucoup d'entre elles, les fonctions sont encore inconnues ou ne peuvent être prédites que sur la base d'homologies de séquences17,18,19,20,21. Les particules du virus ASFV contiennent environ 82 protéines virales, mesurent environ 250 nm et sont multicouches. Ils comprennent une membrane lipidique externe, une capside externe icosaédrique, une membrane lipidique interne, une capside interne, une coque centrale protéique épaisse et un nucléoïde contenant le génome18,19,22,23.

Les particules du virus ASFV pénètrent dans leur cellule hôte soit par endocytose médiée par la dynamine et la clathrine24,25, soit par macropinocytose26,27. Une fois que les particules du virus ASFV ont été internalisées, elles transitent par toute la voie endolysosomale. Directement après l’infection, ils peuvent être détectés dans les endosomes ou macropinosomes précoces par microscopie électronique et par colocalisation de protéines virales avec des marqueurs endosomaux spécifiques (EEA1 et Rab5)26. À des moments ultérieurs, le virus de la PPA est détecté dans les endosomes tardifs ou les lysosomes colocalisés avec CD63, Rab7, Lamp1 et la cathepsine26,28. Au cours de ce transport, les particules d'ASFV subissent d'importants changements structurels qui se traduisent par des virions dépourvus de membranes externes et de capsides externes au sein des endosomes tardifs multivésiculaires. L’enveloppe interne exposée des particules d’ASFV fusionne ensuite avec la membrane endosomale, entraînant la libération de particules centrales nues dans le cytoplasme26. Après une étape d’initiation courte et mal comprise au sein du noyau, la réplication de l’ADN viral et la morphogenèse des particules virales ont lieu dans le cytoplasme dans des usines à virus périnucléaires adjacentes au centre organisateur des microtubules29. Pour la formation de particules virales de descendance, des membranes dérivées du réticulum endoplasmique (RE) sont acquises et des virions intracellulaires constitués du génome contenant le noyau interne, la capside interne, l'enveloppe interne et la capside externe sont assemblés. Ces virions intracellulaires sont ensuite transportés le long des microtubules jusqu'à la périphérie cellulaire et acquièrent leur membrane lipidique externe par bourgeonnement à partir de la membrane plasmique34,35,36. Les virions intracellulaires ainsi que les virions à double enveloppe sont infectieux32.